图 纳米孔道鉴定蛋白质酪氨酸硫酸化翻译后修饰示意
在国家自然科学基金项目(批准号:22027806)资助下,南京大学龙亿涛教授团队在天然多肽/蛋白质酪氨酸硫酸化翻译后修饰检测方面取得新进展。研究成果以“基于纳米孔道的酪氨酸硫酸化状态直接测量(Direct Mapping of Tyrosine Sulfation States in Native Peptides by Nanopore)”为题,于2024年9月25日在《自然•化学生物学》(Nature Chemical Biology)发表。论文链接:https://doi.org/10.1038/s41589-024-01734-x。
酪氨酸硫酸化作为一种重要的蛋白质翻译后修饰,对蛋白质-蛋白质相互作用调控及多种生理和病理过程至关重要。研究表明,约1%的酪氨酸残基可能被硫酸化,然而,由于检测方法的限制,迄今仅有约160种酪氨酸硫酸化蛋白质被实验鉴定,大量重要硫酸化蛋白及其功能有待检测发现与阐明。目前,酪氨酸硫酸化检测的难点主要在于三个方面:首先,酪氨酸硫酸化对温度和pH敏感,容易在质谱检测中丢失;其次,酪氨酸的另一种翻译后修饰——磷酸化,与硫酸化仅存在微小的分子量差异(仅差0.0095 Da),使得检测的特异性和灵敏度都受到限制;此外,硫酸化蛋白质丰度极低,且在纯化分离过程中的低稳定性进一步增加了检测的复杂性和难度。因此,亟需发展一种单分子测量技术,能够直接且精准地鉴定天然蛋白中的酪氨酸硫酸化状态。
针对此问题,研究团队在仪器研制项目资助研发的“纳米孔道单分子蛋白质测序仪器系统”上,发展了一种通用型蛋白质酪氨酸硫酸化检测方法,能够在无需纯化分离的条件下,直接鉴定并定量混合体系中的低丰度硫酸化酪氨酸,突破了现有纳米孔道检测技术仅适用于测定特定已知多肽序列、难以应用于实际未知蛋白质分析的局限。同时,结合全原子分子动力学模拟,验证了硫酸化诱导的非共价相互作用增强机制,证明了这种纳米孔道序列非依赖性硫酸化识别策略的可靠性,为进一步鉴定未知的酪氨酸硫酸化蛋白质提供了强有力的分析工具。