基因组中的一些序列会导致基因的开启或关闭。到目前为止,这些基因开关,或所谓的增强子,都被认为在DNA上有自己的位置。因此,不同的增强子相互分离,即使它们控制着相同的基因,并在身体的不同部位开启它。波恩大学和慕尼黑大学最近的一项研究挑战了这一观点。这一发现也很重要,因为基因开关被认为在进化中起着核心作用。这项研究发表在《科学进展》杂志上。
植物和动物形态的蓝图被编码在它们的DNA中。但是只有一小部分基因组——哺乳动物中大约2%——包含基因,即制造蛋白质的指令。其余部分主要控制着这些基因在何时何地活跃:它们的转录本产生了多少,以及这些转录本产生了多少蛋白质。
其中一些调控序列被称为“增强子”,其工作原理就像我们客厅里用来调节光线的调光开关。事实上,它们会在需要这种基因的地方和时间特异性地增加特定基因的表达。控制形态的基因通常对几个独立的增强子作出反应,每个增强子决定基因在不同身体部位的表达。
增强子控制
到目前为止,增强子被认为是模块化的。这个术语意味着每个增强子占据DNA的一段独立的片段。“然而,我们已经证明,这不是绝对正确的,”Mariam Museridze解释说。她是波恩生物研究所Nicolas Gompel教授小组的博士生,也是该研究的第一作者。Gompel也是跨学科研究领域(TRA)的成员。波恩大学的“生命与健康”
研究人员研究了果蝇中一种叫做yellow的基因是如何被调节的。这种基因使昆虫产生褐色色素黑色素。有许多增强剂可以控制黄色的活性。例如,其中一种负责蛆虫牙齿的色素沉着,而另一种负责果蝇腹部条纹图案的形成。
Museridze说:“我们已经仔细研究了其中两种增强剂。”前者控制翅膀上颜色图案的形成,而后者控制头部、胸部和腹部的颜色。在果蝇的蜕变过程中,两者同时活跃。研究小组发现,身体增强子并不像预期的那样位于与翅膀增强子不同的DNA区域。相反,有大量的DNA区域属于这两个基因开关,即它们影响翅膀和身体的色素沉着。
结果表明,基因组中调控序列的结构比以前认为的要复杂得多。这对性状在进化过程中如何变化有着深远的影响。根据目前的知识,增强剂在这一过程中起着关键作用。
作为进化"游乐场"的增强剂
这是因为许多蛋白质对生物体非常重要,以至于它们的基因(即包含构建蛋白质指令的DNA序列)发生突变会导致严重的问题,甚至必然死亡。因此,控制体型的基因,如翅膀或腿的数量,在进化过程中很少改变。增强子提供了一种摆脱这种困境的方法:当它们发生突变时,相应基因的活性会发生变化,但只在特定的组织和特定的时间发生。
“因此,突变增强子的成本通常低于直接突变基因的成本,”Mariam Museridze说。这使得在进化过程中更容易出现新的特征。这就像烤蛋糕一样:如果你把鸡蛋、面粉、牛奶和糖混合在一起,根据混合比例的不同,你可以得到完全不同类型的面团。在这个比喻中,增强者将负责成分的数量,而不是成分的类型。
基因突变就像意外地用完全不同的东西取代了一种成分——例如,用锯末代替面粉。结果肯定不会很好吃。另一方面,增强子的突变会改变面粉的数量。Museridze说:“如果增强子不像我们想象的那样模块化,这意味着它们中的突变可以产生更广泛的影响。”这意味着这样的突变可以同时影响几种成分的含量。然而,也有可能增强子保持其独立性,并继续控制单一成分的数量,即使它们的序列相互交织和共享。“我们现在想更详细地研究这些可能性,”Gompel教授解释说。“我们还想弄清楚我们的发现有多普遍,以及这如何影响我们对进化机制的理解。”