CRISPR-Cas13在转录组扰动和治疗应用中存在非特异性RNA降解的可能性，这引起了人们的关注。我们发现，只有在RfxCas13d表达量很高的情况下才会出现非特异性活性。

在转录组规模和组合筛选中使用低拷贝数的RfxCas13d，我们实现了高特异性的RNA敲低，而没有广泛的非特异性活性。

此外，对高保真Cas13变体的分析表明，其非特异性活性的降低可能是由于其整体核酸酶活性的减弱。