痘苗病毒会引发包括天花和猴痘(mpox)在内的严重疾病,对人类健康构成重大威胁。痘苗病毒核心蛋白酶(CorePro)对于病毒成熟至关重要,并且在痘苗病毒中高度保守,这使其成为极具吸引力的抗病毒靶点。然而,CorePro的结构一直未知,这阻碍了抗病毒药物的开发。
在此,研究人员测定了猴痘病毒(MPXV)无配体的 CorePro以及它与一种用于治疗肌肉萎缩症的候选药物阿洛司他丁(aloxistatin)复合物的结构。这些结构显示,CorePro形成了一种具有独特 “舞蹈伴侣” 折叠的同型二聚体。CorePro的催化中间状态由一种来自天然底物的醛衍生物(I-G18)来表征。这种衍生物与催化半胱氨酸 328(Cys328)共价结合,使得病毒蛋白酶的活性位点在底物结合时,从无配体形式的闭合构象转变为有利的开放构象。

基于 CorePro-I-G18 复合物,研究人员设计了一系列带有腈基弹头的拟肽抑制剂,它们能够与催化 Cys328 共价结合。这些化合物抑制 CorePro的 IC50值在 44.9 - 100.3 nM 之间,也展现出强大且广泛的抗痘苗病毒活性。该研究为设计针对痘苗病毒感染的广谱抑制剂奠定了基础。

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