圣路易斯华盛顿大学医学院的研究人员近日报告了一种检测急性髓系白血病(AML)的新方法,有望彻底改变这种疾病的检测和治疗方式。这种基于数字PCR的检测方法可以改善由KMT2A基因融合驱动的白血病检测,并有可能影响治疗决策和应答评估。
这篇题为“Droplet Digital PCR for Oncogenic KMT2A Fusion Detection”的论文发表在《The Journal of Molecular Diagnostics》杂志上。
急性髓系白血病是一种罕见的侵袭性癌症,全球每年约有12万人确诊。治疗过程中残留病灶的检测对于评估预后和指导治疗决策至关重要。目前,在AML治疗过程中,检测微小残留病(MRD)的方法包括骨髓形态学、多参数流式细胞术(MPFC)和DNA测序。
形态学评估只能检测到5%的白血病细胞。多参数流式细胞术的检测灵敏度更高,可达0.01%至0.001%,但在实施和解释方面具有挑战性,而且不同实验室之间没有标准化。DNA测序方法可以通过体细胞突变图谱来识别白血病细胞,但这种方法价格昂贵,而且可能会受到非白血病血细胞的干扰。
通讯作者、圣路易斯华盛顿大学医学院肿瘤学系的Grant A. Challen博士解释说:“致癌融合通常是疾病的特征,也是白血病细胞的独特标志物,通常不存在于健康细胞中。其他疾病,比如慢性髓系白血病(CML),可以通过典型的BCR-ABL融合来追踪,灵敏地检测这些融合已经彻底改变了CML的治疗方式。”
“对于带有致癌融合的AML患者,KMT2A融合是一种分子标志物,可实现灵敏的残留病检测。因此,我们希望开发出一个灵敏的KMT2A融合检测平台,以改进我们检测和治疗这种疾病的方式,”他说。
研究人员利用微滴式数字PCR(ddPCR)技术开发出一种新型检测方法,能够对五个最常见的KMT2A融合伴侣进行检测。目前已知有80个KMT2A融合伴侣,但大约80%的融合只涉及到五个伴侣 – AF9、AF6、、AF4、ELL和ENL。
他们在人类细胞系和患者样本中对这种方法进行基准测试,以证明KMT2A融合检测的灵敏度和特异性。实验将cDNA分子分液到微流控液滴中,这些液滴利用引物和探针进行检测,只有当融合转录物存在时才会产生阳性信号。他们将针对不同融合的多个引物/探针组合成一种混合的融合检测试剂。
Challen博士指出:“我们发现,这种检测方法不会在健康个体的样本中产生假阳性信号。它很容易扩展,以包含更多的致癌融合。这有望帮助医生确定治疗方案和评估应答状况。了解治疗是否有效,对于决定何时升级治疗或进行造血干细胞移植至关重要。”
他总结道:“这是一种可以灵敏检测KMT2A融合的强大工具,适用于由这些融合驱动的白血病患者的疾病检测。它填补了致癌融合检测的空白,并带来了一些技术改进。这种检测方法还具有可扩展性,可轻松添加其他融合,以便覆盖更大的范围。我们正在逐步改进血癌的检测!”